姚卓君出生于黑龙江省哈尔滨市，从小受杨靖宇和王传圣的影响，而立志要当一名解放军战士。大学毕业后，他步入了影视界，成为长春电影制片厂的一名演员

1992年，出演个人首部电视剧《罪恶》，从而正式进入演艺圈。1993年，出演伊爱群执导的古装武侠剧《浴血狼山》，在剧中饰演英俊潇洒、待人彬彬有礼的段玉。

1995年，出演冯凯执导的年代情感剧《情爱红尘》。1997年，与陈宝国、陶慧敏、孙松合作出演都市情感剧《今冬不言情》。2001年，出演张桥执导的警匪悬疑剧《风蝶雨人》。

2003年，出演侯勇主演的年代剧《无愧苍生》。2005年，出演巫刚主演的抗战剧《杨靖宇将军》，在剧中饰演共产党特派员小孟。

2006年，出演谢祖武、董璇、郭珍霓主演的年代情感剧《木棉花的春天》，在剧中饰演邹筱蝶的父亲邹平维，与郭珍霓饰演一对父女；同年，与林秀玲、王灿、沈世朋合作主演年代情感剧《雪中红》，在剧中饰演胆大机智、心地善良的医师高尚谦。

2007年，出演罗福执导的古装悬疑剧《龙游天下》，在剧中饰演秉公正直的县令郭展鹏。2008年，与巍子、胡军合作出演了古装情感剧《玉井传奇》。

2009年，出演李绮红、陈浩民、于波主演的古装喜剧《包三姑外传》，在剧中饰演爱钱如命的朱大贵；同年，出演李良成执导的谍战剧《世间道》，在剧中饰演无情无义的北平驻守大将军佟二全。

2010年，出演杨玄执导的家庭伦理剧《良家妇女》，在剧中饰演经常暴打周若云的表哥白原，与马雅舒饰演一对表兄妹；同年，与李天柱、江宏恩、陈莎莉合作主演家庭伦理剧《忘掉我是谁》，在剧中饰演女主角林慈惠学生时代的初恋情人沈天云；此外，他还出演了罗灿然执导的年代情感剧《流泪的新娘》，在剧中饰演保安队副队长宋安平。

2011年，出演杨玄、龙真执导的年代爱情剧《桃花劫》，在剧中饰演虽做尽了坏事、却也会对人温暖和善的赵志平；同年，出演李云亮执导的年代情感剧《母亲，母亲》，在剧中饰演充满男子气概的革命军人祝宇中。

2012年10月14日，其主演的家庭情感剧《加油妈妈》在湖南卫视金鹰独播剧场首播，在剧中饰演了女主角李若愚的舅舅、对夏菲菲痴心一片的汪勇；同年，与郭珍霓、谢祖武、陈昭荣合作主演年代情感剧《完美新娘》，在剧中饰演为人霸道、心思缜密的恶霸武介东。

2013年，与靳东、黄曼、郭明翔合作主演抗战剧《狼烟遍地》，在剧中饰演沉默寡言且观察敏锐的国军特务连参谋窖子狼；同年，与黄曼、靳东、陈昭荣合作主演年代励志情感剧《妇道》，在剧中饰演自私无情、唯利是图的白家大公子白国智。

2014年，与靳东、丁子玲联袂主演根据笑颜的同名小说改编的年代悬疑剧《龙器》，在剧中饰演闻春来玉器行大掌柜房户生；10月7日，其与斯琴高娃、陈建斌合作出演的民国情感剧《兄弟兄弟》在安徽卫视上星播出，而他在剧中则饰演了为追求真爱而离家出走的孟天许。

2015年2月19日，其与陈键锋、李依晓、张倬闻合作出演的古装神话剧《封神英雄》首播，而他在剧中则饰演了举义旗讨伐纣王的大周猛将黄飞虎；同年，与由赵韩樱子、刘雨欣、钱泳辰合作出演民国励志情感剧《忍冬艳蔷薇》，在剧中饰演陈正定的父亲陈福贵，与张倬闻饰演一对父子；之后，出演庄训鑫执导的年代传奇剧《传奇大亨》，在剧中饰演男主角顾延枚的哥哥顾桑落，与张翰饰演一对兄弟。

2016年，与富大龙、黄曼合作出演革命战争剧《骡子和金子》，在剧中饰演敢于牺牲自己、带领千军万马走过长征道路的首长。

2017年，出演周晓鹏执导的古装探案剧《盛唐幻夜》；6月，其出演的校园科幻偶像剧《终极三国》在优酷视频首播，而他在剧中则饰演了河东高校的校长董卓，该剧上线4天便突破了1亿播放量。12月出演李云亮执导，小春同名小说改编网剧的《不负如来不负卿》并在该剧中饰演心底温和善良，默默守护一家人，慈爱不失严厉的父亲罗严。

姚卓君的姑父是杨靖宇的贴身警卫员王传圣，他的父亲在其小时候经常用杨靖宇、王传圣的英雄事迹教育他和兄弟姐妹们。

2008年，姚卓君与台湾女演员林秀玲结婚，婚后两人育有一子，由于两人经常分隔两地拍戏，有时他和妻子一年只见一次面。

姚卓君不仅具有沉稳老练的演技，而且他对表演还有着认真的态度和一丝不苟的专业精神。姚卓君也成功塑造了许多荧幕形象，其中在电视剧《忘掉我是谁》中，姚卓君将沈天云的痴情演绎得淋漓尽致。

姚卓君在网络剧《终极三国》中，将表演的力道拿捏得恰当好处，而其自然流畅的演技也获得了观众的好评。从《忘掉我是谁》到《母亲，母亲》，姚卓君无论在剧中的角色性格还是表演功力都让人满意。从反派到革命志士，姚卓君都将剧中的角色演绎得入木三分，给人留下了深刻印象。

姚卓君在电视剧《桃花劫》中，将赵志平这个人物演绎得惟妙惟肖、入木三分。