上一部末端，僧奥（基仆李维斯饰）终究意识到自身的能力战义务，中弹新生后，酿成了无所事事的“救世主”，他战女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝饰），舰少朱菲斯（劳伦斯·菲什伯恩饰）回到了人类的基天锡安，遭到人们的热闹接待。此时，“母体”决意先动足为强，派出了两万五千只电子乌贼袭击锡安基天；朱菲斯、僧奥战崔妮蒂则再次进进“母体”，寻找“制钥者”，准备从外部损坏；而本该被僧奥消灭的特勤史女士似乎出了面问题，脱离了“母体”的掌握，占有恐怖的复制能力，阻碍僧奥他们的举动。